Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkx1-2P42580 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nkx1-2P42580 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nkx1-2P42580 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nkx1-2P42580 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkx1-2P42580 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkx1-2P42580 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkx1-2P42580 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkx1-2P42580 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkx1-2P42580 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkx1-2P42580 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkx1-2P42580 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkx1-2P42580 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkx1-2P42580 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkx1-2P42580 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms