Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Elk3P41971 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms