Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms