Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms