Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtlP38585 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TtlP38585 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TtlP38585 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms