Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin1P35438 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms