Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab21P35282 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab21P35282 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab21P35282 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab21P35282 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms