Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp4P35123 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms