Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms