Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prim2P33610 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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