Protein–RNA interactions for Protein: P33534

Oprk1, Kappa-type opioid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oprk1P33534 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Oprk1P33534 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms