Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc5P32043 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms