Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms