Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms