Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Marcksl1P28667 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms