Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn10P28658 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms