Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja4P28235 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms