Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms