Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BrafP28028 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BrafP28028 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BrafP28028 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BrafP28028 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BrafP28028 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BrafP28028 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BrafP28028 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BrafP28028 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BrafP28028 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BrafP28028 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BrafP28028 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BrafP28028 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BrafP28028 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BrafP28028 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BrafP28028 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BrafP28028 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BrafP28028 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BrafP28028 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BrafP28028 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BrafP28028 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BrafP28028 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BrafP28028 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BrafP28028 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BrafP28028 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms