Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RdxP26043 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RdxP26043 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RdxP26043 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RdxP26043 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RdxP26043 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RdxP26043 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RdxP26043 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RdxP26043 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RdxP26043 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RdxP26043 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RdxP26043 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RdxP26043 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RdxP26043 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RdxP26043 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RdxP26043 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RdxP26043 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RdxP26043 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RdxP26043 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RdxP26043 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RdxP26043 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms