Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itgb7P26011 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb7P26011 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb7P26011 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb7P26011 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb7P26011 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms