Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnd1P25322 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms