Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Zfp978-202ENSMUST00000154154 1250 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm6579-201ENSMUST00000208224 865 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxd11P23813 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd11P23813 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms