Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ggta1P23336 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ggta1P23336 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ggta1P23336 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ggta1P23336 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ggta1P23336 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ggta1P23336 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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