Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TP20293 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TP20293 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TP20293 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TP20293 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TP20293 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TP20293 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TP20293 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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