Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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