Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NefhP19246 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NefhP19246 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NefhP19246 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NefhP19246 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NefhP19246 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NefhP19246 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NefhP19246 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms