Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmga1P17095 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms