Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rag1P15919 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms