Protein–RNA interactions for Protein: P15209

Ntrk2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, mousemouse

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Length 821 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntrk2P15209 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ntrk2P15209 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ntrk2P15209 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ntrk2P15209 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms