Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RpsaP14206 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RpsaP14206 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RpsaP14206 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpsaP14206 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpsaP14206 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms