Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt1P13864 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms