Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms