Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa9P09631 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa9P09631 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms