Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms