Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb1P09055 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms