Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc8P09025 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms