Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TtrP07309 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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TtrP07309 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TtrP07309 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
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TtrP07309 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TtrP07309 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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