Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd4P06332 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd4P06332 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd4P06332 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms