Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P06324 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06324 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06324 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06324 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06324 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06324 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06324 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06324 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06324 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06324 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06324 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06324 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06324 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06324 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06324 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06324 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06324 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06324 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06324 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06324 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06324 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06324 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06324 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P06324 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06324 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P06324 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06324 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms