Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms