Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb1P04202 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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