Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GzmbP04187 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GzmbP04187 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms