Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HbaP01942 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HbaP01942 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HbaP01942 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HbaP01942 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms