Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01878 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01878 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01878 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01878 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01878 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01878 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01878 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01878 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01878 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01878 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01878 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01878 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01878 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01878 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01878 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01878 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01878 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01878 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01878 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01878 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms