Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01667 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01667 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01667 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01667 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01667 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
P01667 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01667 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01667 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01667 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01667 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01667 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01667 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01667 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms