Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp8O89110 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms