Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms