Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3bO88509 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms