Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms